Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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