Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snf8Q9CZ28 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snf8Q9CZ28 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snf8Q9CZ28 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snf8Q9CZ28 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms