Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fcf1Q9CTH6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms