Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpa3Q9CQ71 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rpa3Q9CQ71 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpa3Q9CQ71 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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