Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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