Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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