Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Krt88Q9CPR6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krt88Q9CPR6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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