Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrrtQ99MR6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms