Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms