Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps4Q99KG7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms