Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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