Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Apobec3Q99J72 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Apobec3Q99J72 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Apobec3Q99J72 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Apobec3Q99J72 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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