Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rnf144aQ925F3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rnf144aQ925F3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rnf144aQ925F3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rnf144aQ925F3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rnf144aQ925F3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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