Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smc1bQ920F6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smc1bQ920F6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smc1bQ920F6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smc1bQ920F6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smc1bQ920F6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smc1bQ920F6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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