Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh10Q8VCH7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms