Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc12Q8K2L8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms