Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hpf1Q8CFE2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms