Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nsun3Q8CCT7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms