Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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