Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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