Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Znf428Q8C1M2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Znf428Q8C1M2 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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