Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms