Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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