Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms