Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.9 ms