Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccdc88cQ6VGS5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms