Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snrnp200Q6P4T2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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