Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tpm4Q6IRU2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm4Q6IRU2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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