Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms