Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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