Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim28Q62318 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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