Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VcanQ62059 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VcanQ62059 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VcanQ62059 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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