Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cd47Q61735 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cd47Q61735 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cd47Q61735 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cd47Q61735 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms