Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gli3Q61602 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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