Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TefmQ5SSK3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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