Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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