Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mdc1Q5PSV9 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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