Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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