Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf608Q56A10 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Znf608Q56A10 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Znf608Q56A10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Znf608Q56A10 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Znf608Q56A10 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Znf608Q56A10 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Znf608Q56A10 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Znf608Q56A10 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf608Q56A10 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms