Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms