Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp19Q3UJD6 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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