Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms