Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms