Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Kdm4dQ3U2K5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms