Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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