Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms