Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc10Q3TLI0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms