Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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