Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms