Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms